Почему в методе главных компонент чаще всего используют первые две?

БОльшее количество компонент трудно визуализировать
В каждой последующей компоненте будет содержаться меньше информации о данных
Вычислять компоненты очень сложно, поэтому ограничиваются двумя
Третья компонента не будет информативна и использовать её не нужно

К сожалению, у нас пока нет статистики ответов на данный вопрос, но мы работаем над этим.