Выбора между адаптацией типового программного комплекса к условиям конкретного применения и разработкой заказной бухгалтерской ИС выполняется на этапе

обоснование конфигурации ИС бухгалтерского учета
выбор методологии разработки И С бухгалтерского учета
обоснование информационно-технологической архитектуры ИС бухгалтерского учета

К сожалению, у нас пока нет статистики ответов на данный вопрос, но мы работаем над этим.