Заявление о согласовании внеплановой выездной проверки с предлагающимися к нему документами направляется в орган прокуратуры:

курьером
заказным почтовым отправлением с уведомлением о вручении
в форме электронного документа, подписанного усиленной квалифицированной электронной подписью

К сожалению, у нас пока нет статистики ответов на данный вопрос, но мы работаем над этим.