Средства заказчика, поступившие на расчетный счет подрядчика:

подлежат налогообложению
не подлежат налогообложению
не могут использоваться непосредственно для выполнения строительных работ без санкции заказчика

К сожалению, у нас пока нет статистики ответов на данный вопрос, но мы работаем над этим.