В системе ДЕЛО справочник Подразделения используется для указания в регистрационных карточках

маршрута отправки документа
получателей входящих документов
наименований подразделений, куда направляется документ
получателей входящих документов, авторов исходящих документов, авторов и исполнителей резолюций к документам

К сожалению, у нас пока нет статистики ответов на данный вопрос, но мы работаем над этим.