Может ли системный анализ деятельности предприятия проводить сторонний аналитик

нет, не может, системный анализ должен проводится внутренними специалистами
да, может, при этом привлечение сотрудников предприятия совершенно не требуется
да, может, но необходимо привлечение специалистов предприятия для получения информации

К сожалению, у нас пока нет статистики ответов на данный вопрос, но мы работаем над этим.